乙肝病毒S基因变异S基因由前S1、S2和S区3部分组成,有3个起始密码子,共用一个终止密码子,分别编码HBV包膜上前S1蛋白、前S2蛋白和S蛋白。S区基因位于HBV核苷酸第155~833位,编码226个氨基酸的外膜蛋白,即HBsAg。S区的2个肝脏特异性启动子序列SP1、SP2,分别指导2.4kbmRNA和2.1kbmRNA的转录,前者主要翻译大分子蛋白(L蛋白),后者主要翻译中、小蛋白(即M蛋白和S蛋白)。2.1kbmRNA的转录是2.4kbmRNA转录的10倍。因此,通常情况下体内M蛋白、S蛋白含量高于L蛋白。M蛋白、S蛋白、L蛋白的比例改变可引起肝功能严重损害。S基因的“a”肽段相对保守,位于S蛋白的第124~147位氨基酸序列中,由于半胱氨酸的二硫键作用形成2个茎环关结构,分别为2个克隆抗体结合位点。
前S区基因有翻译前S与S抗原蛋白的启动子,故突变株的基因缺失部位包括S基因启动子时,则可抑制HBs抗原的生成,从而影响HBV的复制。前S区的最先39个基因序列极富变异性,按所翻译的氨基酸序列分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型,因与各HBs亚型前S2氨基酸序列具有相同性而分别命名为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型前S2。有学者用对各型前S2具特异必的引物进行分离病毒株DNA的PCR分析发现,HLA-A24阳性患者的血清ALT高水平其间可检出I型前S2,而于ALT复常后此即消失而转变为其它型前S2。类似的相关性亦见于HLA-A2与II型前S2之间,提示前S2抗原与HLA-I类复合物为细胞损害性T淋巴细胞抗原决定簇的可能性。
S区基因突变包括S亚型点突变和抗体逃逸突变。S区基因的翻译产物表面抗原可引发机体产生保护性抗体(抗-HBs),对HBV的免疫预防及治疗有重要意义。以往认为此抗体可保护机体免受HBV感染,但随着临床诊断水平的不断提高,HBsAg(-)/抗HBs(+)HBV-DNA(+)或HBsAg(+)/抗HBs(+)HBV-DNA(+)的现象越来越受到临床医师的关注。有关学者利用PCR及测序技术,相继在S基因区发现不同位点的突变[5-6],且S区最易发生缺失突变,龙其多见于乙肝疫苗接种后和肝移植患者应用高效价乙肝免疫球蛋白之后者。抗体逃逸突变(antibody-escape mutant)是“a”决定簇上的氨基酸出现替换、缺失或插入,引起抗体脱逸而感染却仍持续的变异。目前所知以“a”决定簇G